Pinho Leal (1873) refere que em 1030, estando esta povoação deserta, terá sido povoada pelo régulo de Lamego Zadam Aben Uvim, a quem se deverá então a sua fundação. Da corrupção de Aben ou Bem Uvim terá derivado o actual nome de Goujoim.
Também há quem defenda que topónimo possa ter provindo de Mogim, nome de um possível colono de raiz germânica.
Conforme consta do Cadastro da População do Reino, de 1527, sabe-se que Goujoim já era Villa, sede de conselho, antes do século XVI.
Goujoim surge no tempo com diferentes grafias: Gojim. Gomjoym, Gomjoim, Gojoim, e finalmente Goujoim. É curioso verificar que durante muito tempo terão coexistido lado duas povoações exactamente com o mesmo nome Gojim, o que só si justifica a evolução de um dos nomes, e por aí surgiu Goujoim.
Goujoim antigamente era uma aldeia rica em azeite, centeio, vinho e trigo. As ruas eram eliminadas por candeeiro de azeite fito na azenha da freguesia, alguns desses candeeiros ainda existem mas não são utilizados, só existem para embelezarem a Freguesia, só que já tão um bocado deteriorados.
Também tem um forno muito antigo onde coziam o pão, ainda hoje estão em funcionamento mas só na época da Páscoa. Mas ainda tão ao estilo antigo.
